Lempira cuenta una cara desconocida del guerrero Lenca que emprendió una feroz resistencia al embate de la conquista española, uniendo y liderando a los pueblos originarios de la actual Honduras. Marcado desde nacimiento por la sangre y la muerte, Lempira deberá aprender a dominar su carácter impulsivo y defender a su gente en contra del avance de los españoles, que tejen alianzas con otrora aliados locales y no se detendrán hasta conquistar las Hibueras para fincarse ahí.
Con la muerte de Entepica, cacique y jefe de la resistencia de los pueblos lencas, Lempira es escogido por el pueblo para guiarlos y detener a los conquistadores. Conocedor de la geografía y con un olfato de batalla estratégico, Lempira y su ejército pondrán a prueba el poderío español, que tendrá que recurrir a la traición para hacer caer al héroe que defendió a su tierra y a su gente.